2003年1月，在全面实行条状领导的基础上，为提高奉贤校区管理、教学、服务工作的水平，增强整体管理力量，提升学校内涵，有效推进奉贤校区各项工作，校党委决定成立新的奉贤校区工作党委和奉贤校区管理委员会。新的奉贤校区工作党委和管委会，作为校党委和校行政的派出机构，按照“以条为主，条块结合，贴近实际，强化管理”的指导方针，适当强化块状功能，履行好管理、指导、协调、督查、保障、服务、调研、应急职能，落实校党委、行政各项决策，协调各部门、各学院间工作关系。
为加强对奉贤校区的管理，学校党政和校区两委会先后制定了若干工作制度。主要有： ①校党政垂直领导与校部派出机构管理协调相结合；
②校党政领导在校区工作和夜间轮值；
③工作党委和管委会工作责任制度；
④各部处和各学院干部配备及工作制度；
⑤学生工作人员和辅导员常驻校区；
⑥教师夜晚辅导答疑制度；
⑦加强校园学术文化氛围，学术文化资源共享；
⑧校区机关“午间无休”制度；
⑨校区工作应急预案制度；
⑩学生辅导员联谊会、学生宿舍网格化管理制度。
两委会成员
奉贤校区工作党委成员（按姓氏笔画为序）：
马友协 王雅君 王 军 刘 方 孙 勇 朱龙章
许亦娣 何云峰 吴沛东 张月芳 张建业 张爱良
李 明 沈爱良 陈渊平 单冠初 周建平 周银娥
金国忠 胡志明 施 斌 徐继耀 顾中忙 高 亭
高建华 盛 春 蒋明军 缪德良 樊连生 潘国建
薛和生 戴 冰
奉贤校区管委会成员（按姓氏笔画为序）：
丛玉豪 刘 方 刘 平 宋燕明 张建业 张峥嵘 李 明
李培华 周建平 高伟勋 高建华 蒋明军 缪德良 戴 冰
奉贤校区工作党委书记、管委会主任：高建华
奉贤校区工作党委副书记：李 明
奉贤校区管委会副主任： 李 明(兼) 缪德良
主 任：周建平
副主任：刘 方
奉贤校区工作党委、管委会办公室（奉贤校区办公室）